Тут нужно учитывать пару моментов.

На момент встречи на Мустафаре Энакину подснесло крышу чередой промчавшихся событий (предательство джедаев, присяга Сидиусу, резня в храме, выпил сепаратистов), то есть Энакин был уже явно не в себе, действовал на эмоциях.
Но Падме он зла не желал, он даже обрадовался ее увидев, хотя и удивился. Решающую роль тут сыграло появление Оби-Вана, Энакин тут же переменился и не став разбираться записал Падме в предательницы.
Но даже после этого он не собирался ее убивать, удушение было в стиле "задолбала, потом поговорим, пока полежи в отключке". Если бы он просто хотел убить ее, то проще было бы сломать шею Силой или мечом рубануть.

Собственно, вспомните его беспомощное, разочарованное "NOOOO" в конце фильма, ясно же, что Падме была для него важна и всё что он затеял было изначально ради нее.

Да, я согласен, что Энакин оказался полным идиотом и сам же привел жену к смерти, от которой стремился уберечь.
Но этот итог в контексте фильма абсолютно логичен и закономерен. Лукас провел через фильм пусть простейшую, но мораль - не стоит действовать с горяча, а то наломаешь дров. А еще, устами Йоды, он призывал к смирению "Не трогай включенную плиту, болван Отпусти всё то, что потерять боишься".

Собственно, если бы Энакин поступил как настоящий джедай в тот момент и отпустил терзавшие его страхи о Падме, глядишь, все кончилось бы хеппи эндом. Но чем дело кончилось мы все знаем - в переломный момент внутри Энакина взял верх не джедай, а простой человек.

Короче, всё сказанное возвращает нас к первоначальному тезису. (Про то, что мол без дополнительных материалов поступки персонажей вызывают фейспалм.) И если в случае с Финном и Фазмой это действительно так, и пробелы в логике этих персонажей затыкаются костылями из книг, то в примере с Энакином всё обстоит иначе - логика персонажа отлично вырисовывается по одним фильмам, без необходимости читать дополнительные материалы.


Это забавный момент, согласен. Тут имеем то ли косяк сценария, то ли своеобразную логику - пока Энакин метался не зная как быть, Сидиус его обнадежил, тем, что знает тайну. А как только Энакин предал джедаев, Сидиус включил заднюю, мол тайну знаю, но не до конца, но сказал тебе как бы правду, с определенной точки зрения.
И куда было деваться Энакину при таком раскладе? К джедаям вернуться уже нельзя, а если предать еще и Сидиуса, тогда он останется вообще один против всех. Вот и получилось, что деваться некуда с подводной лодки.