На мой взгляд их несколько:
Упустили Улика Кель-Дрому
Прошляпили падение Куна
Не принимали участие в Мандолорских Войнах
Изгнали Изгнанницу (извините за тавтологию)
Не проверили факт уничтожения всех ситхов на Руусане
Прошелкали появление Дарта Сидиуса

Превращение в почти несамостоятельную структуру боевых монахов на поводке у Сената и канцлера Республики. Которая даже не смогла воспрепятствовать отмене анти-ситского законодательства. А это уже предательство и забвение основной задачи Ордена джедаев – служения Силе и противостояния Тёмной Стороне во всех её проявлениях. Остальное уже – лишь последствия. Джедаи стали слепы, что продемонстрировали Войны клонов, где они сражались как солдаты, а не воины Света. Они сами попались в расставленную ловушку ситов.

И каким бы образом это им помогло? Ну, не признавался бы Палыч в таком случае, что он ситх, или сделал бы это так, чтобы такие обвинения джедаев против него выглядели бы голословными. Что бы это поменяло для джедаев?

У него был бы уже коридор решений. Где он мог бы тоже совершить ошибку. А у джедаев было бы больше рычагов и возможностей для слежки и поиска ситов или их миньонов.