Такое впечатление, что все уже почему-то решили, что Рей - дочь Люка. Почему так?

P.S. и по-моему уже пора разбивать обсуждение на отдельные темы, а то тесновато уже в одном мегатреде на сто страниц

Безумная, но вполне занятная и мотивированная теория происхождения Рей. Если вкратце, то Трилогия Сиквелов - это Metal Gear Solid 2, и все повторы неслучайны.

Фильм The Boys from Brazil заинтересовал, посмотрю, но теория никакая, смешано несколько мыслей. То Рей - клон Энакина, то Люка. То рука использовался как материал для клонирования, но сжечь в атмосфере её планировали после титров. В итоге непонятно и противоречиво.
По поводу Metal Gear Solid, я не в курсе сюжета серии, автор конкретно никаких похожих моментов не привёл. Википедия не помогла разобраться.

Илан, можешь немножко кратко описать, почему Трилогия Сиквелов - это Metal Gear Solid 2 ?

Так все же расписано:

In 2001’s audacious Metal Gear Solid 2, video game designer and director Hideo Kojima created a game that deliberately echoed its predecessor, almost note-for-note. Eventually, it’s revealed that this isn’t an accident, or laziness. The parallels are part of the plot, as it turns out the game’s protagonist, Raiden, has been unwittingly taking part in a simulation of the plot of the previous game – it’s a training program, intended to create and condition soldiers on par with the previous game’s hero, Solid Snake.

Смысл в том, что во многих отношениях - характерные локации, сценарий с заложниками и ядерной угрозой, типажи антагонистов, отношения между ключевыми персонажами, общее развитие сюжета - MGS2 является чуть ли не ремейком первой части. Но впоследствии выясняется, что так оно с самого начала и было спланировано главными злодеями франшизы. Они как можно более точно реконструировали события из первой игры, чтобы посмотреть, насколько поведение и развитие навыков нового главного героя Райдена будет соответствовать навыкам "идеального солдата" Солида Снейка из оригинального сюжета. Планировалось собрать данные и использовать при тренировке нового поколения солдат.

Правда, в самом финале сюжет вновь переворачивается с ног на голову, и главному герою объявляют, что события игры были социальным экспериментом искусственного интеллекта, который исследовал поведение людей и методы контроля над ними, чтобы сохранить интеллектуальный потенциал человечества, который в новом тысячелетии оказался под угрозой из-за неадекватно возросших объемов информации, которую люди просто не способны нормально обрабатывать и отсеивать.

You know. Kojima.